MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015183	AG	3	6	235814	235819	50 %	0 %	50 %	0 %	325291673
4502	NC_015183	GCA	2	6	235857	235862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291673
4503	NC_015183	GAA	2	6	235940	235945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291673
4504	NC_015183	ACA	2	6	235988	235993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291673
4505	NC_015183	ACCCGC	2	12	236228	236239	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325291674
4506	NC_015183	CAT	2	6	236243	236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291674
4507	NC_015183	CGC	2	6	236268	236273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291674
4508	NC_015183	ATG	2	6	236274	236279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291674
4509	NC_015183	GC	3	6	236383	236388	0 %	0 %	50 %	50 %	325291674
4510	NC_015183	CAG	2	6	236396	236401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291674
4511	NC_015183	T	6	6	236595	236600	0 %	100 %	0 %	0 %	325291674
4512	NC_015183	CGC	2	6	236627	236632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291674
4513	NC_015183	T	6	6	236641	236646	0 %	100 %	0 %	0 %	325291674
4514	NC_015183	CGG	2	6	236648	236653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291674
4515	NC_015183	TCG	2	6	236682	236687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291674
4516	NC_015183	CAC	2	6	236695	236700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291674
4517	NC_015183	GCA	2	6	236722	236727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291674
4518	NC_015183	GC	3	6	236852	236857	0 %	0 %	50 %	50 %	325291674
4519	NC_015183	TGA	2	6	237023	237028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291675
4520	NC_015183	TCG	2	6	237079	237084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291675
4521	NC_015183	AG	3	6	237093	237098	50 %	0 %	50 %	0 %	325291675
4522	NC_015183	ATC	2	6	237099	237104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291675
4523	NC_015183	GTCC	2	8	237149	237156	0 %	25 %	25 %	50 %	325291675
4524	NC_015183	GTC	2	6	237165	237170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291675
4525	NC_015183	AGG	2	6	237184	237189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291675
4526	NC_015183	ATG	2	6	237271	237276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291675
4527	NC_015183	TCG	2	6	237358	237363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291675
4528	NC_015183	AGC	2	6	237398	237403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291675
4529	NC_015183	TCG	2	6	237474	237479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4530	NC_015183	CAGCG	2	10	237488	237497	20 %	0 %	40 %	40 %	325291676
4531	NC_015183	CCTT	2	8	237552	237559	0 %	50 %	0 %	50 %	325291676
4532	NC_015183	CG	3	6	237632	237637	0 %	0 %	50 %	50 %	325291676
4533	NC_015183	GCC	2	6	237662	237667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
4534	NC_015183	GCC	2	6	237672	237677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
4535	NC_015183	GCG	2	6	237700	237705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291676
4536	NC_015183	GCC	2	6	237753	237758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
4537	NC_015183	GAT	2	6	237845	237850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291676
4538	NC_015183	ATC	2	6	237942	237947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291676
4539	NC_015183	ACC	2	6	238013	238018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291676
4540	NC_015183	TCG	2	6	238026	238031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4541	NC_015183	TCG	2	6	238042	238047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4542	NC_015183	CCG	2	6	238099	238104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
4543	NC_015183	GAC	2	6	238151	238156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4544	NC_015183	CGA	2	6	238171	238176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4545	NC_015183	GCA	2	6	238225	238230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4546	NC_015183	GAAGGA	2	12	238286	238297	50 %	0 %	50 %	0 %	325291676
4547	NC_015183	CGT	2	6	238300	238305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4548	NC_015183	CCG	2	6	238324	238329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
4549	NC_015183	CG	3	6	238328	238333	0 %	0 %	50 %	50 %	325291676
4550	NC_015183	GTC	2	6	238433	238438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4551	NC_015183	TGA	2	6	238489	238494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291676
4552	NC_015183	CAT	2	6	238586	238591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291676
4553	NC_015183	CTG	2	6	238598	238603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4554	NC_015183	CGA	2	6	238675	238680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
4555	NC_015183	ATT	2	6	238901	238906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291676
4556	NC_015183	CCA	3	9	238963	238971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291676
4557	NC_015183	ATCGA	2	10	239139	239148	40 %	20 %	20 %	20 %	325291676
4558	NC_015183	GCC	2	6	239180	239185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
4559	NC_015183	CGG	2	6	239398	239403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291677
4560	NC_015183	GCA	2	6	239440	239445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291677
4561	NC_015183	TG	3	6	239474	239479	0 %	50 %	50 %	0 %	325291677
4562	NC_015183	TCGCTT	2	12	239488	239499	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325291677
4563	NC_015183	CGA	2	6	239504	239509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291677
4564	NC_015183	TGC	2	6	239550	239555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291677
4565	NC_015183	CGG	2	6	239576	239581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291677
4566	NC_015183	CCG	2	6	239600	239605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291677
4567	NC_015183	GAG	2	6	239611	239616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291677
4568	NC_015183	GC	3	6	239651	239656	0 %	0 %	50 %	50 %	325291677
4569	NC_015183	GC	3	6	239954	239959	0 %	0 %	50 %	50 %	325291677
4570	NC_015183	TCG	2	6	239998	240003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291677
4571	NC_015183	GC	3	6	240066	240071	0 %	0 %	50 %	50 %	325291677
4572	NC_015183	CGG	2	6	240075	240080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291677
4573	NC_015183	CAG	3	9	240120	240128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291677
4574	NC_015183	TTTC	2	8	240140	240147	0 %	75 %	0 %	25 %	325291677
4575	NC_015183	GGC	2	6	240174	240179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291677
4576	NC_015183	TGGC	2	8	240217	240224	0 %	25 %	50 %	25 %	325291677
4577	NC_015183	GCA	2	6	240255	240260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291678
4578	NC_015183	CGG	2	6	240418	240423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291678
4579	NC_015183	GCA	2	6	240446	240451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291678
4580	NC_015183	ATGCC	2	10	240507	240516	20 %	20 %	20 %	40 %	325291678
4581	NC_015183	TCCGG	2	10	240559	240568	0 %	20 %	40 %	40 %	325291678
4582	NC_015183	TCG	2	6	240603	240608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291678
4583	NC_015183	GCC	2	6	240615	240620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291678
4584	NC_015183	CAC	2	6	240644	240649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291678
4585	NC_015183	GC	3	6	240779	240784	0 %	0 %	50 %	50 %	325291678
4586	NC_015183	CTT	2	6	240990	240995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291679
4587	NC_015183	ACG	2	6	240997	241002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291679
4588	NC_015183	GGT	2	6	241004	241009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291679
4589	NC_015183	ATCA	2	8	241017	241024	50 %	25 %	0 %	25 %	325291679
4590	NC_015183	GCA	2	6	241067	241072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291679
4591	NC_015183	GCT	2	6	241081	241086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291679
4592	NC_015183	TCA	2	6	241111	241116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291679
4593	NC_015183	GCGA	2	8	241119	241126	25 %	0 %	50 %	25 %	325291679
4594	NC_015183	GC	3	6	241136	241141	0 %	0 %	50 %	50 %	325291679
4595	NC_015183	ACT	2	6	241276	241281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291679
4596	NC_015183	ATG	2	6	241414	241419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291680
4597	NC_015183	GC	3	6	241473	241478	0 %	0 %	50 %	50 %	325291680
4598	NC_015183	CGC	2	6	241506	241511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291680
4599	NC_015183	GGCGA	2	10	241555	241564	20 %	0 %	60 %	20 %	325291680
4600	NC_015183	CTT	2	6	241579	241584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291680
4601	NC_015183	CGAAGA	2	12	241632	241643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325291680
4602	NC_015183	CAG	2	6	241675	241680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291680
4603	NC_015183	GTCGAG	2	12	241756	241767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325291680
4604	NC_015183	CGG	2	6	241772	241777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291680
4605	NC_015183	CGC	2	6	241796	241801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291680
4606	NC_015183	GTG	2	6	241865	241870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291680
4607	NC_015183	GGTG	2	8	241914	241921	0 %	25 %	75 %	0 %	325291680
4608	NC_015183	CGT	2	6	241968	241973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291680
4609	NC_015183	CCA	2	6	242022	242027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291681
4610	NC_015183	GGC	2	6	242102	242107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291681
4611	NC_015183	TGC	2	6	242124	242129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291681
4612	NC_015183	AGG	2	6	242163	242168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291681
4613	NC_015183	GCAG	2	8	242186	242193	25 %	0 %	50 %	25 %	325291681
4614	NC_015183	TGG	2	6	242205	242210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291681
4615	NC_015183	GTG	2	6	242228	242233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291681
4616	NC_015183	GGTC	2	8	242245	242252	0 %	25 %	50 %	25 %	325291681
4617	NC_015183	TGA	2	6	242289	242294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291681
4618	NC_015183	CTT	2	6	242297	242302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291681
4619	NC_015183	TCGG	2	8	242308	242315	0 %	25 %	50 %	25 %	325291681
4620	NC_015183	CCGG	2	8	242632	242639	0 %	0 %	50 %	50 %	325291682
4621	NC_015183	GATCG	2	10	242646	242655	20 %	20 %	40 %	20 %	325291682
4622	NC_015183	TCG	2	6	242728	242733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291682
4623	NC_015183	AGGC	2	8	242750	242757	25 %	0 %	50 %	25 %	325291682
4624	NC_015183	TGC	2	6	242763	242768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291682
4625	NC_015183	TCG	2	6	242773	242778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291682
4626	NC_015183	GCGG	2	8	242788	242795	0 %	0 %	75 %	25 %	325291682
4627	NC_015183	TGA	2	6	242819	242824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291682
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4630	NC_015183	CTG	2	6	242925	242930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291682
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4634	NC_015183	CGC	2	6	243102	243107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291682
4635	NC_015183	GCC	2	6	243111	243116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291682
4636	NC_015183	CCGT	2	8	243172	243179	0 %	25 %	25 %	50 %	325291682
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4645	NC_015183	AAG	2	6	243591	243596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291682
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4649	NC_015183	GTC	2	6	243809	243814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291683
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4651	NC_015183	AACC	2	8	243853	243860	50 %	0 %	0 %	50 %	325291684
4652	NC_015183	CTGC	3	12	243966	243977	0 %	25 %	25 %	50 %	325291684
4653	NC_015183	TCG	2	6	244071	244076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291684
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4662	NC_015183	CTG	2	6	244355	244360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291684
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4739	NC_015183	CTCG	2	8	248209	248216	0 %	25 %	25 %	50 %	325291688
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4741	NC_015183	CGG	2	6	248304	248309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291688
4742	NC_015183	GCA	2	6	248312	248317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291688
4743	NC_015183	CGG	2	6	248328	248333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291688
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4780	NC_015183	AGCCG	2	10	249953	249962	20 %	0 %	40 %	40 %	325291690
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4853	NC_015183	AGCTGG	2	12	253610	253621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325291695
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4856	NC_015183	GCA	2	6	253698	253703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
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4858	NC_015183	GCC	2	6	253801	253806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
4859	NC_015183	CCG	2	6	253830	253835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
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4861	NC_015183	CGA	2	6	253911	253916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
4862	NC_015183	CGG	2	6	253935	253940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
4863	NC_015183	TGA	2	6	253968	253973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291695
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4865	NC_015183	CAT	2	6	254049	254054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291695
4866	NC_015183	GCG	2	6	254081	254086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
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4870	NC_015183	GTC	2	6	254173	254178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
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4876	NC_015183	GCA	2	6	254659	254664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
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4883	NC_015183	CAT	2	6	255195	255200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291695
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4918	NC_015183	GGCC	2	8	256863	256870	0 %	0 %	50 %	50 %	325291697
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4963	NC_015183	GCG	2	6	259656	259661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291700
4964	NC_015183	CCA	2	6	259670	259675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291700
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4969	NC_015183	GGC	2	6	259924	259929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291700
4970	NC_015183	GCC	2	6	259959	259964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291700
4971	NC_015183	GGC	2	6	259976	259981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291701
4972	NC_015183	GC	3	6	260021	260026	0 %	0 %	50 %	50 %	325291701
4973	NC_015183	ATC	2	6	260066	260071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291701
4974	NC_015183	GCGT	2	8	260094	260101	0 %	25 %	50 %	25 %	325291701
4975	NC_015183	ATGC	2	8	260158	260165	25 %	25 %	25 %	25 %	325291701
4976	NC_015183	GCA	2	6	260180	260185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291701
4977	NC_015183	GC	3	6	260323	260328	0 %	0 %	50 %	50 %	325291701
4978	NC_015183	CTC	2	6	260342	260347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291701
4979	NC_015183	CTG	2	6	260426	260431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291701
4980	NC_015183	TG	3	6	260516	260521	0 %	50 %	50 %	0 %	325291701
4981	NC_015183	AGA	2	6	260522	260527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291701
4982	NC_015183	TGC	2	6	260714	260719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291702
4983	NC_015183	AAT	2	6	260727	260732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291702
4984	NC_015183	TG	3	6	260791	260796	0 %	50 %	50 %	0 %	325291702
4985	NC_015183	TG	3	6	260987	260992	0 %	50 %	50 %	0 %	325291702
4986	NC_015183	CAT	2	6	261030	261035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291702
4987	NC_015183	CGCGG	2	10	261036	261045	0 %	0 %	60 %	40 %	325291702
4988	NC_015183	CGT	3	9	261057	261065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291702
4989	NC_015183	GCG	2	6	261218	261223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291702
4990	NC_015183	GCCGA	2	10	261280	261289	20 %	0 %	40 %	40 %	325291702
4991	NC_015183	CGG	2	6	261363	261368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291702
4992	NC_015183	GCC	2	6	261403	261408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291702
4993	NC_015183	GGA	2	6	261486	261491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291702
4994	NC_015183	ACCA	2	8	261502	261509	50 %	0 %	0 %	50 %	325291702
4995	NC_015183	GGAGGC	2	12	261564	261575	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325291702
4996	NC_015183	CG	3	6	261583	261588	0 %	0 %	50 %	50 %	325291702
4997	NC_015183	GTC	2	6	261607	261612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291702
4998	NC_015183	GAA	2	6	261630	261635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291702
4999	NC_015183	GCG	2	6	261664	261669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291702
5000	NC_015183	GCT	2	6	261710	261715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291703

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